长期以来沙门氏菌一直被认为是在动物和人类上具有经济意义的重要的食源性人畜共患病原体，根据意大利帕尔马欧洲食品安全局的M. Hugas和P.A. Beloeil发表在Eurosurveillance的文章所述。
沙门氏菌的主要宿主是家畜和野生动物的肠道，这会导致各种动物和植物来源的食品污染。这种风险颇受欧盟（EU）食品经营者（FBO）和决策者的重视。在过去十年沿着食物链，从初级生产到消费，增量实施综合立法来监视和控制沙门氏菌已经取得了重大进展，但是，正如Kinross等1在一篇关于S. Stanley（斯坦利沙门菌）在欧盟持续爆发的文章中所述挑战仍然存在。
欧盟人和动物食源性疾病的监测
在欧盟，人类食源性沙门氏菌病的监测是强制性的2,3。食源性疾病爆发需要进行全面的流行病学研究4。在欧盟人畜共患病包括沙门氏菌，在食源性动物及其食品中一直被监测4。欧洲食品安全局（EFSA）和欧洲疾病预防和控制中心（ECDC）一直编制和分析人类、动物和食品相关数据，并在欧盟每年的人畜共患病、食源性疾病的趋势和来源的总结报告中列出。
2012年的报告显示，与往年一样，肠炎性沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌和单相鼠伤寒沙门氏菌1,4,[5],12:i:-是到目前为止与人类疾病最常有关的血清型（图1），接着是S.Infantis（婴儿沙门氏菌）。在2011年和2012年S. Stanley发病率分别占人类病例的0.8％和1.4％[5]。人肠炎沙门氏菌病例主要与消费被污染的鸡蛋和禽肉有关，而鼠伤寒沙门氏菌病例则大多与消费受污染的猪肉、禽肉和牛肉有关5。
EFSA Hugas Salmonella EU
图1. 欧盟10种最常见的人感染沙门氏菌血清型，2012年（N=82409）5
沙门氏菌已从多种食品，主要是各种肉类和肉类产品中被分离出。在2012年，在报告的一组国家5中沙门氏菌阳性单样比例最高的是新鲜的鸡肉和火鸡肉，平均水平为5.5％，而在新鲜的猪肉和牛肉中，其比例分别为0.7％和0.2％，为集团报告国家5中。
家禽沙门氏菌国家控制方案
在动物中，特别是在家禽中，沙门氏菌引起大多亚临床感染，这种生物有机体容易在动物畜群或鸡群内传播而不被发现；动物可以成为间歇性或持续的健康带菌者。沙门氏菌在家禽中的患病率被认为是沙门氏菌在生鲜蛋和禽肉中存在的主要危险因素。为了控制各种生产类型的家禽和火鸡中的沙门氏菌，以及限制禽类产品污染的风险，已按照欧盟法规实施了国家沙门氏菌控制和监视计划（NCP）6。
针对几种血清型沙门氏菌的NCP被认为具有特别的公共卫生意义，是在选定的禽群中设立的，如Gallus gallus（原鸡）种鸡、产蛋母鸡和肉鸡，以及育种和育肥的火鸡，这是基于证据认为这些群体具有最高的传播沙门氏菌的风险。目标沙门氏菌血清型包括肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、 S. Hadar、婴儿沙门氏和S. Virchow在Gallus gallus的种群以及肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌在计划覆盖的其他禽群中。鼠伤寒沙门氏菌还包括单相鼠伤寒沙门氏菌1,4,[5],12：I-。
NCP在不同国家会存在一些变化。但是，它们都是基于相同的原则和目标。 NCP通常包括对感染沙门氏菌鸡群的预防措施的系统性执行，对禽群沙门氏菌状态的彻底监控，一旦检测出感染沙门氏菌则实施控制措施以防感染扩散。在农场或孵化场固定阶段用统一的抽样计划和规范的分析方法对禽群进行目标沙门氏菌血清型检测。
除了Gallus gallus的种鸡群，欧盟沙门氏菌目标是由欧洲委员会（EC）与欧盟成员国磋商之后然后在欧盟范围内进行流行行调查后设立的6。具体的沙门氏菌控制计划和削减目标均逐步从2005年往后设立7-14。在火鸡的育种和育肥中，沙门氏菌强制性NCPs在2010年1月1日生效8,14,15并在2013年再次确认16。
欧洲食品安全局监控是否各国满足了欧盟沙门氏菌患病率降低目标，取得进展。在2012年大多数国家都满足了在家禽上的沙门氏菌降低目标，在欧盟目标沙门氏菌血清型的患病率显著下降或在家禽中保持稳定5。
在确认的人类病例在欧盟， 20125人兽共患病的图2 。报告发病率
食品中沙门氏菌控制卫生规则
FBO致力于对食品原材料卫生的一般要求，如实施基于危害分析和关键控制点（HACCP ）和良好的卫生习惯的程序17，以及关于动物源性未加工和加工产品，包括禽肉及其肉制品的具体的卫生要求和程序18。
此外，在绞肉和肉制品特别是家禽中FBO应遵守沙门氏菌具体的食品安全标准。这些标准定义了投放市场的食品的可接受程度。沙门氏菌补充加工卫生标准，特别是关于肉鸡和火鸡胴体，设置了一个指示值，高于该值需要采取纠正措施，以保持加工期间的卫生19。
最后，用于人类消费的动物源性产品的官方控制确保了与卫生条件有关的法律体制被FBO正确执行20。
沙门氏菌国家控制计划的成功
在2007年，在欧盟沙门氏菌病是第二个最常报道的人畜共患病，有151995人感染病例，在过去四年欧盟在沙门氏菌病的通报率上表现显著的下降趋势21。在2012年欧盟通报的人感染沙门氏菌病例数量继续减少到91034例（图2 ）。这种下降是过去五年观察到的30％下降趋势的一部分。假定所观察到的人沙门氏菌病病例的减少主要源自家禽（Gallus gallus）沙门氏菌控制计划的成功，尽管其它控制措施也可能导致减少。
EFSA Hugas Salmonella Campylobacter EU
图2.在欧盟2012年证实的人感染病例中人畜共患病的通报率5
这些结果表明，FBO和兽医公共卫生当局急会继续投资于沙门氏菌的控制，而且这项工作正在取得进展，虽然挑战仍然存在。
在家禽生产部门流行血清型存在的挑战
尽管事态在积极发展，但是非主要的目标沙门氏菌血清型会偶尔涉及食源性爆发。在这期Eurosurveillance上，Kinross等人报告了在2011-12年发生的一个不同寻常的菌株S.Stanley血清型的跨境爆发，在欧盟10国报道有700个非旅游相关的人感染病例1。
这个数字大概只占冰山一角，因很多病例可能还没有在不同国家被监控系统捕获。调查只在受感染国家展开，随后由欧盟委员会经济合作和欧洲食品安全局协调，发现火鸡生产链是其爆发源头。最近，由于S. Stanley表现相似的微生物学特性（即耐环丙沙星），在2014年4月在奥地利人感染沙门氏菌病例又被检测出，而且还与火鸡肉有关，这表明疫情仍可能在以一个或几个类似的来源在持续着1,22。
2012年3月，欧洲食品安全局采取了关于设立降低火鸡沙门氏菌发生率的新目标的公共卫生影响评估的科学意见16。最后结论是与2007年的情况相比，在火鸡上采取控制措施有助于大大减少火鸡相关的人感染沙门氏菌病例的数量。
从相关法规进一步证实要集中在降低肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌，包括单相鼠伤寒沙门氏菌的目标从2013年开始。此外，针对血清型的多样性要求告知完整的血清分型，除了鸡群中流行的目标血清型。在必要时，在火鸡上除了肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌外，沙门氏菌血清型的目标控制必须受该病在单个国家流行率和公共健康的影响的指导。如果有足够的信息能可靠地识别具有公共卫生意义的特殊菌株，Hugas和Beloeil认为，应予以考虑加入这些菌株作为欧盟范围内的目标部分。