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随着水禽的养殖密度增大，品种增多，贸易活动的频繁，生产中大型养殖场和很多散养户并存，不同禽类混养，种蛋来源复杂，洪涝灾害的不断的发生，这些因素导致了水禽疫病的复杂化。“多”：疫病的数量不断增多；“新”：老病新貌，主要表现：
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1）是临床病情的变化
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2）新的血清型出现
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3）基因型的改变
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4）突破种间屏障
“新”病不断的出现，如鸭的3型腺病毒毒病，鹅星状病毒病，鸭的圆环病毒病等。“杂”体现在共感染现象的增多，研究发现：水禽疫病的双重和三重的共感染现象增多。主要体现在以下10个方面。
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1）发病率居高不下
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2）出现免疫抑制鸭病
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3）老的鸭病出现新貌
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4）垂直鸭病危害加大
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5）新的鸭病不断增多
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6）细菌性鸭病疗效差
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7）共同感染增多
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8）免疫鸭带毒较重
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9）突破种间屏障的鸭病出现
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10）条件性鸭病出现变化
以鸭流感为例，禽流感是由A型流感病毒引起家禽的感染，主要是鸡、鸭、鹅、鸽子等感染的出现疫病综合症。主要表现：隐性感染，亚临床症状，轻度呼吸系统症状，种禽和蛋禽类产蛋下降，最严重的可见出现急性大量死亡。(6) 种（蛋）鸭发病表现为产蛋异常和较低的死亡率。在生产中流行的主要的亚型表现，在种蛋鸭和肉鸭不相同， 种蛋鸭上面有h5n1，h5n6，h5n8，h9n2，h7n9 以及他们之间的共感染，优势的亚型主要是h5n6和h9n2，在肉鸭上流行的亚型h5n1，h5n6，h5n8，h7n9，优势的亚型h5n6。鸭流感的临床上分为四型：出血型，神经型、坏死型和减蛋型。出血型：眼结膜明显出血，红肿， 脑膜的严重的出血， 肝脏表面的严重的出血，胰腺表面出血明显，肺脏水肿，出血，肠道淋巴结肿胀，出血，肠道黏膜出血、出现明显的血凝块，肾脏严重出血，临床剖检中可见以出血症状为主。神经型：表现为神经症状，扭脖子、翻转，在地上打滚，眼结膜发白，躺在地上，有的侧翻， 成年鸭表现为脚弓反张，剖检病变主要在脑部脑，脑组织严重的水肿、坏死。 坏死型：心肌表面的白色的条纹，肌纤维明显的坏死，胰腺白色坏死点，此外也能看到大量的的针尖样坏死点。大量透明样的坏死点，融合之后会形成坏死灶。减蛋型：侵害卵巢，引起卵黄囊的充血、出血，直接影响产蛋。 流感的防控遵循24字的方针：加强领导、密切配合、依靠科学、依法防治、群防群控、 果断处置，这也是目前临床染病防治的基本方针。鸭流感的防控：免疫预防加扑灭，16个字方针：乡不漏村、村不漏户、户不漏禽、禽不漏针，确保证疫苗的接种率达到百分之百，免疫效果：接种疫苗后，抗体效价要达到6log2以上，80%为阳性。肉鸭和种蛋鸭使用疫苗的情况：对于h5、h7在肉鸭上推荐1-2针 ，蛋种鸭上可增加免疫次数，对h5型，经过抗体检测甚至要达到4针，免疫日龄要提前，免疫剂量要加大，首次免疫的剂量加大到0.6-0.7毫升，免疫的日龄也可提前到5-7天。
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