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发酵中药是在中药中添加适当的益生菌进行发酵，将中药中的大分子化学物转化为小分子物质，从而获得便于被机体吸收的营养原液的一种手段。中药发酵酵素中不仅含有大量的蛋白质、糖类、维生素、氨基酸等营养物质，还含有生物碱，多糖等活性物质，其具有安全，绿色等特性，所以深受人们所喜爱，常被用于动物养殖及食品上。中药酵素不仅具有益生菌的特性及作用，还具有一定的药理效果，所以它的发展前景是非常大的。
中药酵素的功能及作用非常多样，由发酵原料所决定，那么，中药发酵除了将分子量变小之外，还有什么作用？中药发酵有什么好处与坏处？
发酵中药的好处与坏处
（1）发酵增加了中药中功能性成分的含量：中药的发酵是微生物进行新陈代谢的过程，而在微生物的新陈代谢中，会产生一些代谢物。这些代谢物能对机体起到积极的作用。比如，微生物代谢产生的酶类物质能促进中药细胞壁内有效成分的提取，从而增加中药中功能性成分的含量。发酵还能促进中药中细胞蛋白的代谢，从而提高产品中优质蛋白的含量。微生物在新陈代谢的同时也会促进中药中功能性成分的释放，从而提高中草药的药效。发酵中药在工艺上比传统中药更加先进，其吸收利用率更加高。
（2）发酵提高了中药的药效：中药经过发酵会将中药中的成分转化为小分子物质，这些小分子物质进入机体能快速被机体所吸收利用，这样能大大减小肠胃的消化压力，还能提高机体对中药的利用率，从而提高中药的药效。
（3）中药发酵比传统酵素中的毒副作用更小：是药三分毒，而且并不是所有中药都能单独使用的，有一些中药过度服用就容易导致机体中毒，而中药经过发酵能将中药中的部分有毒物质转化为其它成分的小分子物质，从而降低中药的毒素。而且中药发酵后一般会添加入适量的调配品，提高中药的口感，从而使中药更容易被人们所接受。
（4）在中药的发酵过程中能产生其它的活性成分：微生物发酵过程所代谢得到的一些物质属于活性成分，而中药与这些活性成分互相帮助，进行各种化学反应，能产生新的功能性成分，从而增加中药的作用及效用。
（5）中药发酵的利用率比传统中药更高，能在一定程度上保护环境：传统的中药大多利用烹煮或水泡的形式来进行处理，这样并不能完全将中药的功能性成分及营养价值提取出来，而且这种中药残渣还非常不容易降解，容易引发环境污染。而经过发酵的中药能将其功能性成分大部分提取，可以高效地节省资源，且它的成分大多在发酵过程中会被降解，所以中药发酵还能在一定程度上保护环境。
（6）中药发酵是中药现代化的表现，是中药与科技创新的结合：中药发酵是非常严格的一个过程，需要有科学的配方和可靠的发酵过程，中药发酵将不可控的中药炮制过程化学可控化过程，是中药现代化的表现。
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